由於非營利研發機構所提供之知識與專業服務，具有頗多外部性效益，因此其經營績效之良莠不僅攸關組織的存續，甚至關係到整個社會資源配置之決策。因此，如何解決傳統財務報表評估組織績效所遭遇到偏向短期有形效益評估、事後指標性質、無法具體量化外部效益與無形資産之缺失，是研究非營利研發機構績效重要的管理課題。鑑此，本研究的第一個目的，嘗試從不同的角度並參照奧地利研究中心之智慧資本報告，以工研院爲例，建構工研院智慧資本報告架構，以更公平、客觀及透明的角度揭露研發機構的隱藏價值，與國外非營利研發機構建立之智慧資本報告，進行標竿比較，提供未來發展之改善方向。第二個目的乃是探索研發機構之人力資本、結構資本、關係資本與績效之間的關聯性，實證結果顯示人力資本、結構資本、關係資本三者均與成果效益間有高度正相關，驗證了智慧資本乃是研發組織根本價值來源之論點。